Die ausgebildete Werbefachfrau war in der Werbeabteilung des Konsum Vereins Zürich beschäftigt, danach in den Züricher Werbeagenturen Matter Leo Burnett und Wunderman Cato Johnson. Nach zwei Zwischenjahren als Kuoni-Reiseleiterin war sie vor ihrem Eintritt in die Marxer Immobilien bei der Sportmarketing-Agentur Weirather Wenzel & Partner beschäftigt.

Im August 2000 ist Isabelle Marxer in die Geschäftsleitung von Marxer Immobilien eingetreten.

Zunächst hat sie das firmeninterne Kopiercenter geleitet. Nach dem Verkauf des Kopiercenters im Jahre 2003 hat sie die gesamte Geschäftsbuchhaltung, das Personalwesen sowie das Marketing der Firma übernommen.

Im Oktober 2008 hat sie zudem die Vermietung von Büro- und Gewerberäumlichkeiten übernommen.

Seit September 2017 ist sie zudem für die Bewirtschaftung zuständig.

Im Verein Wirtschaftsforum Liechtenstein (wifo.li) ist sie ehrenamtlich im Vorstand als Kassierin tätig. Ihre weitere Freizeit verbringt sie am liebsten mit ihrer Hündin Bella, Singen, Klavier spielen und Yoga.